交通运输部迅速成立抗震救灾应急抢险指挥领导小组，下设道路抢通组、运输保障组、宣传组、后勤服务组、综合组和恢复重建组。同时，抗震救灾工作和交通运输部的整体工作，要有机结合，统筹安排，既要做好抗震救灾工作，又要做好当前的重点工作。

　　交通运输部要求，全国各级交通主管部门充分认识公路交通运输在抗灾救灾工作中的极端重要性，高度重视，精心组织，迅速组织力量赶赴灾区，尽最大努力帮助灾区做好抗灾救灾相关工作。

　　交通运输部要求，灾区各级交通主管部门要立即启动应急响应，成立由主管领导牵头的专门工作班子，明确专人负责，严格执行24小时值班制度。各级公路机构要立即组织技术力量，加强对灾区以及通往灾区的公路巡查，全面摸清地震灾害对公路交通造成的损失和影响。同时在抗震抢险救灾期间，还要加强对本地区公路网运行的监控，及时了解公路抢通及交通通阻等情况并在每天16时30分前上报部值班室。

　　交通运输部还及时启动了全国水路突发事件应急预案应对汶川地震，交通运输部水路应急指挥中心要求：一是四川、重庆、湖北、湖南在确保人身安全的前提下，排查和检测航电枢纽受损情况，对有隐患的要停机停航；二是保障通信畅通，有重要情况及时报告。