据日本国立传染病研究所传染病信息中心介绍，在日本，人们直到１９６７年才认识到手足口病的存在。根据该中心发布的传染病发生动向调查，日本国内手足口病的 流行高峰为夏季，也有一些病例在秋冬发病。在最近２０多年里，１９８５年、１９９０年、１９９５年和２０００年，手足口病基本上每隔５年就会在日本发生一次较大规模的流行。

　　虽然手足口病尚没有特效药，但是这种病一般病情温和，通常可以在７天至１０天内康复。手足口病出现恶性并发症的几率很小。

　　根据１９９９年４月１日生效的《传染病法》，日本按照症状的轻重和病原体感染力的高低将传染病分为一类至五类传染病。２００３年１１月施行的《传染病法》修正案将手足口病划归危害较小的第五类传染病，国家对手足口病的发病动向实施调查，并根据结果向国民和医疗相关人士公开必要的信息。

　　日本全国目前共有约３０００所小儿科定点监控单位，每周都要向上级相关部门报告手足口病最新情况。日本许多都道府县级政府网站设立了专栏或者通过专门的传染病信息中心网站通报每周更新的手足口病发病数量等信息。

　　由于坚持对病情的流行情况实施严密监控，即使有些年份集中流行，手足口病也没有给日本造成严重影响。